Ovim programom uspostavljen je rad na kartama mineralnih sirovina Republike Hrvatske i geološke potencijalnosti mineralnih sirovina. Prvenstveno je istraživanje usmjereno na sistematizaciju postojećih podataka o primarnih i sekundarnih ležištima i pojavama mineralnih sirovina te utvrđivanje geološke potencijalnosti mineralnih sirovina. U bazama podataka za mineralne sirovine prikupljeni su podaci za više od 3500 ležišta i pojava mineralnih sirovina RH. Izrađuju se karte mineralnih sirovina i karte geološke potencijalnosti mineralnih sirovina pojedinih županija RH, na temelju litostratigrafskih podloga Osnovne geološke karte RH, u sklopu izrada Rudarsko-geoloških studija županija. Baze podataka mineralnih sirovina služe kao prostorna baza za izradu jedinstvenog informacijskog sustava mineralnih sirovina, a izrađuje se i prilagođava u skladu s INSPIRE direktivom Europske komisije. Institut ima glavnu ulogu u izradi i provedbi strategije gospodarenja mineralnim sirovinama RH. Djelatnici provode detaljna istraživanja ležišta nemetalnih mineralnih sirovina kao što su ležišta opekarskih glina, građevno-tehničkog kamena i sirovine za cementnu industriju na temelju izrade elaborata o rezervama mineralnih sirovina i ostalih studija. Djelatnici Instituta članovi su tijela zaduženih za dobivanje koncesija za istraživanje i eksploataciju mineralnih sirovina unutar sektora za rudarstvo, čime su upoznati s politikama i legislativom mineralnih sirovina, kao i prostornim planiranjem vezanim za mineralne sirovine. Znanstveni cilj je razviti modele utjecaja mineralnih sirovina na okoliš, rješavanje postanka pojedinih tipova ležišta mineralnih sirovina i razvijanje modela procjene geološke potencijalnosti mineralnih sirovina temeljem obrade različitih geopodataka i korištenjem daljinskih istraživanja (satelitskih snimaka, termalnih spektara). Razvoj istraživanja mineralnih sirovina važna je komponenta i programa Obzora 2020, te programa Europskog instituta za inovacije i tehnologiju u području mineralnih sirovina (EIT RM), u kojem Institut sudjeluje kao projektni partner. Očekuje se da će glavnina projekata vezana za istraživanje mineralnih sirovina biti financirana iz ovog fonda u narednim godinama. Navedene djelatnosti istraživanja mineralnih sirovina pozicionirale su Institut kao središnji autoritet u Hrvatskoj u području mineralnih sirovina i ekonomske geologije.